在《蜜丝婷大草莓和小草莓对比》中，战斗系统虽然包含回合制和即时制两种模式，但表现上略显平庸，缺乏深度。游戏的战斗在一个可变的格子地图上进行，没有地形的高低差异或遮挡物，且不包含反击或属性克制系统。
敌人的行动缺乏多样性，通常仅围绕最基本的攻击模式展开，使得游戏战斗难以提供长时间的吸引力。
玩家在游戏中会遇到重复的敌人行为模式，缺乏策略的需要。尽管战斗界面设有侧击和背击伤害加成，但这些设置并没有显着扩展玩家的策略选择空间。实际上，大多数战斗成为了简单的数值比拼，缺少了角色技能之间的互动和连携效果。
《蜜丝婷大草莓和小草莓对比》在角色系统上表现较好。游戏提供了丰富的队友选择，这在一定程度上弥补了战斗设计的不足。玩家可以通过招募多样的角色，避免因战斗难度卡关，使剧情能够顺利推进。
在非战斗系统方面，游戏拥有简化的生产体系和装备制作系统。玩家可以通过搜集材料和学习图纸来制作武器和防具，虽然这一系统并没有过程动画或成功率的变数，但它简化了游戏的复杂度。同时，装备分解系统也提供了一定程度上的素材回收，有助于缓解收集难度。
武器系统中，主角能够修炼多种武术技能，每种技能都有自己的特点和熟练度系统，增加了角色培养的趣味性。尽管各武器间并无明显的强弱之分，但它们提供了不同的战斗体验，使得玩家可以根据个人喜好选择合适的武器类型。
